R语言热图注释连续性变量 / 张生荣

R语言ComplexHeatmap绘制复杂热图heatmap

目录一载入R包数据 1.1 载入ComplexHeatmap包,数据 1.2 绘制最简单的热图二常见“表型”注释读入注释文件 2.1 添加注释,且设置颜色三添加“块”注释 3.1 k- ...

生成测试数据 a1 <- c("f","f","b","b","c,"c") 利用n ...

折线图是通过在它们之间绘制线段来连接一系列点的图. 这些点在它们的坐标(通常是x坐标)值之一中排序. 折线图通常用于识别数据中的趋势. R语言中的plot()函数用于创建折线图. 语法在R语言中创建 ...

目录 1.读取数据 2.AUC和CI的计算 3.利用ggplot2绘图 4.合并多个ROC曲线结果 pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包 ...

目录前言一载入数据,R包 1.1 载入ComplexHeatmap包 1.2 载入数据 1.3 绘制最简单的热图二热图修饰 2.1 颜色 1)连续型变量 2)分类型变量 2.2 标题 1)设 ...

目录前言第一类:工作路径问题未设定工作路径当前路径需要修改第二类:对象名或函数名问题未找到函数名报错函数名大小写问题未找到赋值对象对象赋值不规范第三类:符号问题中文逗号报错绝对 ...

R语言中,for循环运行比较慢 for(i in 1:1000){ print(i^2) } 补充:R语言:for循环使用小结基本结构展示: vals =c(5,6,7) for(v in vals ...

目录准备数据简单热图只对列进行聚类将相关系数显示在图上在图上加上显著性标记准备数据两组变量的数据可以像下面这样处理,分别保存在两个csv文件中. > # 导入数据及数据预处理 &g ...

目录介绍 1.加载包 2.加载数据 3.绘图 4.个性化设置聚类方法 5.个性化添加矩阵 6.颜色设置介绍 R corrplot包提供了一个在相关矩阵上的可视化探索工具,该工具支持自动变量重新排 ...

上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot). Step1. 绘图数据的准备首先还是要把你想要绘图的数据调 ...

目录构造数据集绘制散点修改两坐标轴信息本文是以天猫双十一销量与增长率为例,原始的数据可以参考上一篇文章:用 ggplot 重绘天猫双十一销售额图,这里不再作过多的介绍. 同时整个的天猫双十一的 ...

目录 Step1.绘图数据的准备 Step2.绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的安装.调用 Step4.绘图 Step5.美化老铁们,许久未见啦.顺便说一下,最近可不是小仙同学偷懒 ...

目录 Step1.绘图数据的准备 Step2.绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的安装.调用 Step4.绘图 Step5.美化即便小仙同学决定学习R语言来提升自己作图的“逼格”的时 ...

目录线图单线图多线图横轴文本线图线图线图是反映趋势变化的一种方式,其输入数据一般也是一个矩阵. 单线图假设有这么一个矩阵,第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域,第二列为H3K27 ...

目录 Step1.绘图数据的准备 Step2.绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的安装.调用 Step4.绘图最近小仙同学在Nature Cell Biology上看到了这样一张图, ...

目录前言效果展示小结参考附录:RVirusBroadcast代码前言前几天微博的一个热搜主题是**“计算机仿真程序告诉你为什么现在还没到出门的时候!!!”**,该视频用模拟的疫情数据告诉 ...

R编程语言有许多库来创建图表和图表. 饼图是将值表示为具有不同颜色的圆的切片. 切片被标记,并且对应于每个片的数字也在图表中表示. 在R语言中,饼图是使用pie()函数创建的,它使用正数作为向量输入. ...

我就废话不多说了,大家还是直接看代码吧~ ts1<-ts(test_data$tot_num,frequency = 365,start=c(2017,11,21)) plot(ts1,col= ...

线形图是通过在多个点之间绘制线段来连接一系列点所形成的图形,这些点按其坐标(通常是x坐标)的值排序,并且它通常用于识别数据趋势. 在R中的通过使用plot()函数来创建线形图,语法如下: plot(v ...

查询百度之后,发现在R上一次显示多张图的函数很多,比如layout()或者分屏函数,但是这些都不是我想要的结果. 之后,发现了line()函数可以保留原来图片继续作图,在括号中填入所需画图的部分即可( ...