R语言ComplexHeatmap绘制带分类标签热图 / 张生荣

R语言ComplexHeatmap绘制复杂热图heatmap

目录一载入R包数据 1.1 载入ComplexHeatmap包,数据 1.2 绘制最简单的热图二常见“表型”注释读入注释文件 2.1 添加注释,且设置颜色三添加“块”注释 3.1 k- ...

目录前言加载R包,数据 ggplot2绘制 gganimate 动态参考资料前言介绍一个主要用于绘制动画的ggplot2的扩展包---gganimate包. Hans Rosling的关于“ ...

上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot). Step1. 绘图数据的准备首先还是要把你想要绘图的数据调 ...

上一次小仙同学分享了 facet violin plot的画法,最后还卖了个关子,给大家留了个悬念.科研文章的插图通常要求比较高,不仅要精准地展示出数据,选对图表类型,还需要简洁优美(?翻译成人话就是 ...

有众多的格式和文本文件标准可用于存储数据.用于存储数据的通用格式为分隔符值(即CSV或制表符分割文件).可扩展标记语言(XML).JavaScript对象表示法(JSON) 将数据存储在文本文件中的主 ...

常用统计作图函数汇总 plot() hist() 直方图 stem() 茎叶图 boxplot() 箱线图(盒形图) coplot() 协同图 qqnorm() 正态qq图 qqplot() 两总体q ...

目录准备数据简单热图只对列进行聚类将相关系数显示在图上在图上加上显著性标记准备数据两组变量的数据可以像下面这样处理,分别保存在两个csv文件中. > # 导入数据及数据预处理 &g ...

在讨论级数时,可能需要比对前 n n n项和的变化情况,而随着 n n n的递增,通过动态图来反映这种变化会更加直观,而通过R语言绘制动态图也算是一门不那么初级的技术,所以在此添加一节,补充一下R语言 ...

目录引言一需要安装和导入的包二使用函数及参数三知道各个数据集的个数以及重叠(交叉)的个数 2.1 两个已知数据集的韦恩图 2.2 三个已知数据集的韦恩图四根据数据集合绘制韦恩图 4. ...

最近小仙同学在好几篇文献里看到了这种小提琴图,暂时就肤浅地认为这是作者为了更好地比较对照组与实验组的差别,所以将同一个基因的小提琴图各画了一半,放在一起.为了跟上可视化的潮流,小仙也来尝试画一下这个没 ...

目录一.序二.ggplot2是什么? 三.ggplot2能画出什么样的图? 四.组装机器五.设计图纸六.机器的零件 1. 零件--散点图 1) 变换颜色 2) 拟合曲线 3) 变换大小 4) ...

目录 1. R 中自带的默认绘图 1) PDF 格式 2) EPS 格式 2. ggplot 绘图 1) PDF 格式 2) EPS 格式之前写的博客中有提及过如何在 R 语言中绘制矢量图,然后用于 ...

目录导读一.模拟输入二.venn基础图三.个性化参数调整四.保存导读使用VennDiagram函数包中的venn.diagram函数绘制三数据集venn图. 安装依赖包: # venn图 ...

制图环境: pycharm python-3.6 Seaborn-0.8 热图 import numpy as np import seaborn as sns import matplotlib.p ...

目录 Step1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3. 绘图所需package的安装.调用 Step4. 绘图调整透明度更改顺序更改线条形状今天给大家介绍一下Ridge ...

目录 Step1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3. 绘图所需package的安装.调用 Step4. 绘图今天小仙给大家分享一下Slope chart(坡度图)的画法,我 ...

目录 Step1.绘图数据的准备 Step2.绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的调用 Step4.因子水平排序 Step5.绘图今天给大家分享的是Lollipop chart(棒棒 ...

目录 Step 1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的调用 Step4. 饼图百分比标签准备 Step5.绘图今天要给大家介绍的Pie chart( ...

工作中遇到过许多看起来挺复杂的数据筛选,本质上都可以用排序解决,这里以R自带的mtcar数据集为例做一个记录. 首先简单介绍一下mtcar数据集,mtcar(Motor Trend Car Road ...

目录 Step 1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的调用 Step4. 饼图百分比标签准备 Step5.绘图今天要给大家介绍的Pie chart( ...